Em 2013, segundo o Conselho Municipal de Educação (CME) de Ilhéus, cerca de 30 escolas municipais tiveram o ano letivo de várias turmas invalidado, porque não ofereceram as condições mínimas para a realização das atividades escolares. 

O problema afetou principalmente o calendário das escolas da zona rural.  De acordo com Reinaldo Soares (presidente do CME), a Secretaria da Educação de Ilhéus não conseguiu apresentar um plano de reposição de aulas adequado, que pudesse cumprir o mínimo de 200 dias letivos ou 800 horas de aula.

Segundo o relatório-denúncia do conselho, ao contrário do que alega o governo Jabes, a greve dos servidores municipais não tem relação com o problema de boa parte das turmas cujo ano escolar foi invalidado, pois a maioria acumulava defasagem acima de 40 dias letivos até julho, antes da paralisação dos professores.

Outras escolas que também tiveram problemas para cumprir o calendário só iniciaram o ano letivo em outubro. Estas sim foram penalizadas pelos últimos dias da greve (encerrada no dia 07/10/2013). No entanto, de acordo com Reinaldo Soares, a Secretaria de Educação também não apresentou um plano de reposição de aulas  adequado para o caso desses colégios.

Segundo reportagem do Blog Agravo e do Jornal Bahia Online, com a decisão do conselho, o prefeito Jabes Ribeiro (PP) pode responder por ato de improbidade administrativa. Nesse caso, JR teria que explicar à justiça onde e como seu governo aplicou os R$ 27,9 milhões que a Prefeitura de Ilhéus recebeu em 2013 para realizar investimentos no sistema educacional.